Ο κύριος Αντώνης Μαρινάκης, απόγονος του Αριστείδη Γιωργαντζόγλου Πασά, που ήταν ανώτερο στελέχος στην Οθωμανική ιεραρχία το δέκατο ένατο αιώνα, δώρισε στη Βιβλιοθήκη μια σημαντική συλλογή έντεκα παλαιών βιβλίων που περιέχει περιηγητικά βιβλία και τόμους αραβικής και περσικής λογοτεχνίας που χρονολογούνται από το 16ο μέχρι τον 19ο αιώνα. Ιδαίτερο ενδιαφέρον παρουσιάζουν οκτώ τόμοι του περιοδικού Journal des sçavans, του πρώτου επιστημονικού περιοδικού που τυπώθηκε στην Ευρώπη και ένα παλαιό γερμανικό περιηγητικό βιβλίο του Salomon Schweigger, Ein newe Reyssbeschreibung auss Teutschland nach Constantinopel und Jerusalem (Nürnberg: Johann Lantzenberger, 1608).
Χάρις στη μεσολάβηση του Επιτρόπου της Γενναδείου Απόστολου Δοξιάδη 65 τόμοι από την προσωπική βιβλιοθήκη του Ευάγγελου Αβέρωφ-Τοσίτσα (1908-1990) δωρήθηκαν στη Γεννάδειο από την κόρη του Τατιάνα Αβέρωφ-Ιωάννου. Πολλά από τα βιβλία φέρουν ιδόχειρη αφιέρωση του Κωνσταντίνου και της Ιωάννας Τσάτσου, των οποίων το προσωπικό αρχείο βρίσκεται στη Γεννάδειο. Τρία παλαιά λειτουργικά βιβλία και ένα χειρόγραφο εκκλησιαστικό ξεχωρίζουν για τη σπανιότητά τους, ενώ ένα μικρό ευαγγέλιο τυπωμένο στη Βενετία από το Νικόλαο Γλυκύ το 1818 έχει ένα σπάνιο μεταλλικό κάλυμμα.
Ο Δρ. Alexander Thomas Simos δώρισε στη Βιβλιοθήκη το βιβλιο Travels in various countries of Europe, Asia and Africa [ pt. 2], section the second, volume the sixth: Greece, Egypt, and the Holy (London: Printed for T. Cadell and W. Davies, 1818) προς τιμήν της Επιτρόπου της Γενναδείου Ειρήνης Μοσκαχλαϊδή.